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創(chuàng)新賦能,探索發(fā)現(xiàn):Genevac EZ-2 優(yōu)化新型活性抗菌化合物篩選流程

青霉素大家一定不陌生吧!

青霉素是第一種抗生素,它在90多年前被發(fā)現(xiàn),徹底改變了醫(yī)學(xué)的潛力。抗生素能夠幫助患者從嚴(yán)重感染中康復(fù),并降低手術(shù)傷口感染的風(fēng)險,這點促使它們被常規(guī)用于疾病治療和預(yù)防。


然而,抗生素濫用使得許多細(xì)菌對幾種最有效的抗生素產(chǎn)生了耐藥性。每年有數(shù)十萬人因耐藥性感染而喪生。


多年來,人們已經(jīng)認(rèn)識到,開發(fā)能夠殺死耐藥菌的新型抗生素對于維持現(xiàn)代醫(yī)學(xué)標(biāo)準(zhǔn)和降低風(fēng)險至關(guān)重要。


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新型抗菌劑的開發(fā)

迄今為止,傳統(tǒng)的抗生素發(fā)現(xiàn)方法未能產(chǎn)生治療耐藥性感染所需的新藥。自20世紀(jì)80年代以來,沒有發(fā)現(xiàn)新的抗生素類別;過去三十年上市的所有新抗生素都是現(xiàn)有藥物的變體,利用合成生物學(xué)方法制造,以提高療效和產(chǎn)量。帶著新的緊迫感,研究人員再次從自然界中汲取靈感,以指導(dǎo)新型抗菌劑的開發(fā)[1]。發(fā)現(xiàn)和開發(fā)真正的新抗生素需要具有挑戰(zhàn)性的科學(xué)方法,而且耗時耗力。

英國Bactobio公司并未被這些障礙所嚇倒,而是致力于從細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)包括抗生素在內(nèi)的新型化合物 。蒸發(fā)是其研究方法中的關(guān)鍵步驟,而SP Genevac EZ-2溶劑蒸發(fā)工作站簡化了這一流程。


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Bactobio公司的工作流程

細(xì)菌可以產(chǎn)生種類繁多的化學(xué)物質(zhì),但要從細(xì)菌中分離出新化學(xué)物質(zhì),必須在實驗室中培養(yǎng)天然細(xì)菌樣品。然而,目前只有不到1%的已知細(xì)菌成功培養(yǎng)。而在其余 99% 的細(xì)菌中存在發(fā)現(xiàn)新化合物的潛力巨大。Bactobio 公司正是利用一種以前無法培養(yǎng)的細(xì)菌的新技術(shù)來釋放這種潛力。


Bactobio 公司的細(xì)菌群落培養(yǎng)平臺 (BACCU) 可引導(dǎo)不可培養(yǎng)細(xì)菌的進(jìn)化,使其最終能夠在實驗室環(huán)境中培養(yǎng)。在實驗室中,Bactobio 會篩選這些細(xì)菌,尋找有價值的代謝產(chǎn)物。


迄今為止,Bactobio 已將培養(yǎng)率從不足 1% 提高到超過15%,從而能夠建立用于下游代謝物篩選的新型細(xì)菌物種庫。




Bactobio 通過結(jié)合人工合成與自然環(huán)境因素,對細(xì)菌進(jìn)行定向進(jìn)化改造。借助二代測序技術(shù),公司可全程追蹤基因多樣性,研究微生物組并最大限度減少多樣性流失。同時,Bactobio 運(yùn)用文本挖掘與機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)形成迭代閉環(huán),持續(xù)優(yōu)化定向進(jìn)化流程,從而挖掘出更豐富的微生物資源。


公司的核心目標(biāo)是發(fā)現(xiàn)能有效對抗耐藥菌的新型抗生素。研究人員從各類環(huán)境中采集土壤樣本,分離出此前無法人工培養(yǎng)的細(xì)菌,并對其基因新穎性進(jìn)行篩選;隨后在實驗室中完成培養(yǎng),進(jìn)一步檢測其抗菌活性。


研究團(tuán)隊在活性導(dǎo)向篩選流程中,使用EZ-2離心濃縮儀對液體培養(yǎng)物中提取的代謝物進(jìn)行干燥處理。該流程結(jié)合培養(yǎng)基優(yōu)化、高效液相色譜(HPLC)與質(zhì)譜(MS) 技術(shù),實現(xiàn)從培養(yǎng)菌株到活性化合物的完整開發(fā)。在工作流的每一個環(huán)節(jié),研究人員均使用 EZ-2 完成多種不同溶劑體系下的樣品干燥濃縮。


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Genevac EZ-2 如何提升效率?

Bactobio 自 2020 年成立以來便一直使用 EZ-2,并且確信該設(shè)備顯著提升了研發(fā)產(chǎn)出與工作效率。

“SP Genevac EZ-2 運(yùn)行表現(xiàn)十分出色,是我們實驗流程中關(guān)鍵且可靠的核心設(shè)備。使用僅10 個月,我們就計劃采購第二臺 SP Genevac 設(shè)備,以滿足不斷提升的處理通量需求。這足以證明我們對這款儀器的認(rèn)可,以及它在化合物鑒定流程中發(fā)揮的關(guān)鍵作用。我們也非常欣賞它操作簡便、無需樣品前處理的優(yōu)勢,這極大提升了我們的工作效率?!?/span>

借助 EZ-2,可實現(xiàn)多樣品快速并行干燥,大幅提高篩選通量。設(shè)備無需樣品前處理、支持預(yù)設(shè)程序、設(shè)置簡便,進(jìn)一步提升使用效率。此外,樣品可過夜干燥,最大化提升實驗室日間工作效率。


蒸發(fā)過程條件通常較為苛刻,而在蒸發(fā)期間保障這些新型化合物的樣品完整性至關(guān)重要,可避免珍貴樣品損失與重復(fù)實驗。精準(zhǔn)的樣品溫度控制在此扮演關(guān)鍵角色,SP Genevac EZ-2 搭載的創(chuàng)新技術(shù),能夠在可控條件下完成樣品蒸發(fā),保護(hù)新型化合物的結(jié)構(gòu)完整性。


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Genevac EZ-2 溶劑蒸發(fā)工作站




EZ-2溶劑蒸發(fā)工作站是ATS SP公司生產(chǎn)的臺式系列產(chǎn)品之一。SP公司是生物制藥加工和生命科學(xué)設(shè)備領(lǐng)域的行業(yè)領(lǐng)導(dǎo)者,其產(chǎn)品涵蓋離心蒸發(fā)和濃縮工藝。EZ-2系列于2002年首次推出,目前已發(fā)展到第四代,代表了平行蒸發(fā)技術(shù)的巔峰之作。


EZ-2溶劑蒸發(fā)工作站 結(jié)構(gòu)緊湊,并經(jīng)過精心設(shè)計,可兼容多種常用有機(jī)溶劑,包括腐蝕性酸;

它易于使用,并擁有多項特有的功能,可實現(xiàn)高效的溶劑去除;

EZ-2集成了多種技術(shù),確保溫度和壓力的精確控制,保護(hù)珍貴樣品,并可編程實現(xiàn)全自動運(yùn)行;

智能軟件持續(xù)監(jiān)測并直接控制樣品溫度,以避免過溫現(xiàn)象;

溫度測量來自樣品架,無需與樣品本身接觸,避免污染風(fēng)險;

采用Dri-Pure®防爆沸技術(shù),多個樣品可以一次干燥,無需擔(dān)心樣品交叉污染。

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參考文獻(xiàn)

1.Wright GD. Nat. Prod. Rep 2017;34:694-701.

2.Bactobio www.bacto.bio

3.EZ-2 Series. SP Scientific. (2019). https://www.spscientific. com/Products/Centrifugal_Evaporators___Sample_ Concentrators/Genevac/EZ-2_Series/EZ-2_Series/

4.Suitor JT, et al. One-Pot Synthesis of Adipic Acid from Guaiacol in Escherichia coli. ACS Synthetic Biology, 2020; DOI: 10.1021/ acssynbio.0c00254

5.Moore JM, et al. Use and discovery of chemical elicitors that stimulate biosynthetic gene clusters in Streptomyces bacteria. Methods Enzymol. 2012;517:367-85. doi: 10.1016/B978-0-12 404634-4.00018-8. PMID: 23084948.


Bandyopadhyay S, et al. Discovery of iron-sensing bacterial riboswitches. Nat. Chem. Biol., 2020, DOI: 10.1038/s41589 020-00665-7



Genevac


ATS集團(tuán)是德祥集團(tuán)資深合作伙伴之一。英國Genevac公司成立于1990年,隸屬ATS SP Scientific旗下,一直專注于研究和生產(chǎn)各種離心蒸發(fā)濃縮設(shè)備,其產(chǎn)品廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)、制藥、化學(xué)、分析等領(lǐng)域。



德祥科技


德祥科技有限公司成立于1992年,總部位于中國香港特別行政區(qū),分別在越南、廣州、上海、北京設(shè)立分公司。主要服務(wù)于大中華區(qū)和亞太地區(qū)——在亞太地區(qū)有27個辦事處和銷售網(wǎng)點,5個維修中心和2個樣機(jī)實驗室。


30多年來,德祥一直深耕于科學(xué)儀器行業(yè),主營產(chǎn)品有實驗室分析儀器、工業(yè)檢測儀器及過程控制設(shè)備,致力于為新老客戶提供更完善的解決方案。公司業(yè)務(wù)包含儀器代理,維修售后,實驗室咨詢與規(guī)劃,CRO凍干工藝開發(fā)服務(wù)以及自主產(chǎn)品研發(fā)、生產(chǎn)、銷售、售后。與高校、科研院所、政府機(jī)構(gòu)、檢驗機(jī)構(gòu)及知名企業(yè)保持密切合作,服務(wù)客戶覆蓋制藥、醫(yī)療、商業(yè)實驗室、工業(yè)、環(huán)保、石化、食品飲料和電子等各個行業(yè)及領(lǐng)域。


2009至2021年間,德祥先后榮獲了“最具影響力經(jīng)銷商”、“年度最佳代理商“、”年度最高銷售獎“等殊榮。我們始終秉承誠信經(jīng)營的理念,致力于成為優(yōu)秀的科學(xué)儀器供應(yīng)商,為此我們從未停止前進(jìn)的腳步。


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